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合成生物学│自动化实验室的应用案例(二)

发布时间:2022-06-24 13:10

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爱丁堡基因组平台(TheEdinburghGenomeFoundry,EGF)是位于英国六大合成生物学中心之一爱丁堡大学的一个专门使用高度自动化组装大型 DNA 片段的研究机构。

EGF 可以产生和修饰长达 1 兆碱基对的 DNA 链,以使细胞或整个生物具有新的或改进的功能,可用于编程干细胞来实现个性化医疗,生产疾病检测细菌和增加生物燃料作物的产量。

爱丁堡基因组平台

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# 01

主要设施和能力

第一, 该平台致力于开发用于复杂 DNA 构建项目的软件,并与 Autodesk 合作开发了一种基于网络的、开源的、用户友好的、强大的设计工具——Genetic Constructor,专门用于设计大型 DNA 构建体和组合文库。第二,其多功能的机器人平台可用于广泛的DNA 操作实验,例如 Golden Gate 组装、Gibson 组装、酵母重组以及质粒小提等。第三,该平台可进行一系列的细胞表型分析,包括质谱、定量PCR、高通量微发酵及动力学分析等。第四,该平台可实现对所有的设计、构建和测试过程的监控,以不断优化装配流水线,利用全自动 DNA 装配提供的高度可重复的数据,为机器学习提供基础。

# 02

产品和服务

其主要提供的产品和服务主要包括三方面。首先是DNA 组装服务,EGF为学术和工业客户制造 DNA 材料,尤其是涉及大序列(大于5000 个碱基的序列)大量遗传模块或组合文库的高通量项目。其次是提供广泛的自动化分子生物学实验流程和参数,包括 DNA 转化和纯化,qPCR,平板影印,菌落挑选,动力学实验。此外,EGF 还具有一系列酵母菌株库,可在爱丁堡大学内部销售。



# 03

曼森生物自动化实验室

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文章来源:本文由上海曼森生物整理提供

内容审核:郝玉有博士

排版校对:刘娟娟编辑


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